如果我没有记错，这很好，不同的版本和平共存，但我只是想仔细检查，没有问题的可能性（我在较旧的生产服务器上安装较新版本的.net框架，准备升级一个关键的asp.net 1.1应用程序在不久的将来3.5）。
只要这两个应用程序在不同的AppPool中运行，就像有两个独立的服务器一样。 没问题。
正如Moshe所说，这是与IIS有关的AppPool。 对于.NET来说，1.1和3.5可以共存，不会受到干扰，因为它们运行在不同的内核上。 .NET 4.0也与早期版本完全分开。 微软有一个相当不错的文章，涵盖版本和依赖关系：
.NET Framework版本2.0,3.0和3.5之间的关系不同于版本1.0,1.1和2.0之间的关系。 .NET Framework 1.0,1.1和2.0是完全独立的，无论其他版本是否存在，计算机上都可以存在一个版本。 当版本1.0,1.1和2.0在同一台计算机上时，每个版本都有自己的公共语言运行库，类库，编译器等等。 应用程序开发者可以select要定位的版本。 有关更多信息，请参阅并行执行，针对特定的.NET Framework版本或configuration文件，以及使用MSBuild针对特定版本的.NET Framework。